Servicios del Área Metropolitana de Tokio-Yokohama
Edo contaba con un sofisticado, aunque inadecuado, sistema de acueductos. Tres de ellos traían el agua de las tierras altas al oeste de la ciudad. Muchas casas y grupos de casas tenían pozos, que podían volverse salobres, especialmente en las tierras bajas. (Algunos distritos al este del Sumida estaban por debajo del nivel del mar. El hundimiento, por la extracción de aguas subterráneas, hacía que se hundieran aún más). Así, el suministro de agua dulce era un negocio floreciente.
La mayor parte del agua de la ciudad procede ahora del Tama y, cada vez más, de los ríos Tone. Tokio quiere ir aún más lejos, llevando el agua que ahora fluye hacia el Mar de Japón a través de las montañas por medio de un túnel hasta el Tone. No puede hacerlo por sí mismo, y hay oposición en la prefectura rural más afectada. Yokohama y Kawasaki obtienen el agua del río Sagami, que nace cerca de la base del monte Fuji y desemboca en el océano a poca distancia al suroeste de Yokohama.
En Edo no existían las alcantarillas. El medio común de eliminación de residuos era el carro de aguas residuales, a veces llamado carro «cubo de miel». Un mercado de vendedores, en el que el carretero pagaba por las aguas residuales, se convirtió gradualmente en un mercado de compradores a medida que la ciudad crecía y los campos a los que viajaban los carros se alejaban. Durante los años posteriores a la Primera Guerra Mundial, Shinjuku era conocido como el «ano de Tokio». La ruta principal hacia los campos pasaba por allí, y todas las tardes y noches las carretas se acumulaban a lo largo de la calle principal. Incluso en los años posteriores a la Segunda Guerra Mundial, Tokio era una ciudad muy maloliente. El objetivo de que las alcantarillas den cabida a todas las regiones edificadas está a la vista. Probablemente nunca llegarán a las regiones montañosas e insulares remotas.
Cada día hay que eliminar decenas de miles de toneladas de basura. La masa crece más rápidamente que la población, pues la afluencia trae consigo hábitos de consumo menos cuidadosos y eficientes que en el pasado. En los años posteriores a los Juegos Olímpicos de 1964, la ciudad estuvo al borde de la guerra civil por el problema de qué hacer con la enorme acumulación. Los barrios más pobres del este debían deshacerse de ella, y los barrios ricos del oeste producían la mayor parte. El gobierno de la prefectura aceptó que los acuerdos de eliminación eran injustos. Hoy en día hay plantas de basura por toda la ciudad que incineran lo que pueden. El resto va a parar a los vertederos de la bahía que están en el centro de los planes de desarrollo más grandiosos de la ciudad. Aunque en ellos hay bonitos parques, en su mayor parte siguen siendo un adefesio. De uno de estos vertederos, llamado con gran ironía, aunque probablemente no intencionada, «Isla de los Sueños» (Yume no shima), surgió en 1965 una enorme plaga de moscas que se extendió por la parte oriental de la ciudad. Desde entonces, el lugar está mejor controlado, pero sigue siendo un lugar poco onírico.
La electricidad y el gas son suministrados por empresas privadas. La compañía eléctrica tiene plantas, incluidas las nucleares, tan lejos como la costa del Mar de Japón. La mayor parte del gas se produce en una planta a lo largo de la bahía de Yokohama que se considera una maravilla de la tecnología avanzada.