ABBRIAZIONI E CONVENZIONI

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Istruzioni agli Autori (PDF)

Tempo verbale

ASM raccomanda vivamente, per chiarezza, di usare il tempo passato per narrare particolari eventi del passato, incluse le procedure, le osservazioni e i dati dello studio che si sta riportando. Usate il tempo presente per le vostre conclusioni generali, le conclusioni dei ricercatori precedenti e i fatti generalmente accettati. Quindi, la maggior parte dell’abstract, dei Materiali e metodi e dei Risultati sarà al passato, e la maggior parte dell’introduzione e parte della Discussione sarà al presente.

Siate consapevoli che può essere necessario variare il tempo in una singola frase. Per esempio, è corretto dire “White (30) ha dimostrato che le cellule XYZ crescono a pH 6.8”, “La Figura 2 mostra che le cellule ABC non sono riuscite a crescere a temperatura ambiente” e “L’aria è stata rimossa dalla camera e i topi sono morti, il che dimostra che i topi hanno bisogno di aria”. Nel riportare statistiche e calcoli, è corretto dire “I valori per le cellule ABC sono statisticamente significativi, indicando che il farmaco ha inibito. . .”

Per una discussione approfondita di tensione nella scrittura scientifica, vedere How To Write and Publish a Scientific Paper, 7th ed.

Abbreviazioni

Generale. Le abbreviazioni dovrebbero essere usate come un aiuto per il lettore, piuttosto che come una comodità per l’autore, e quindi il loro uso dovrebbe essere limitato. Abbreviazioni diverse da quelle raccomandate dalla IUPAC-IUB (Biochemical Nomenclature and Related Documents, 1992) dovrebbero essere usate solo quando se ne può giustificare la necessità, come nelle tabelle e nelle figure.

È spesso possibile usare pronomi o parafrasare una parola lunga dopo il suo primo uso (ad esempio, “il farmaco” o “il substrato”). Si possono anche usare simboli chimici standard e nomi banali o i loro simboli (folati, Ala, Leu, ecc.).

Definire ogni abbreviazione e introdurla tra parentesi la prima volta che viene usata; per esempio, “le colture sono state coltivate in Eagle minimal essential medium (MEM)”. In generale, eliminate le abbreviazioni che non sono usate almeno tre volte nel testo (comprese le tabelle e le legende delle figure).

Non richiedono introduzione. Oltre alle abbreviazioni per le unità di misura del Système International d’Unités (SI), altre unità comuni (es, bp, kb, e Da), e i simboli chimici per gli elementi, i seguenti dovrebbero essere usati senza definizione nel titolo, nell’abstract, nel testo, nelle legende delle figure e nelle tabelle:

  • DNA (acido desossiribonucleico)
  • cDNA (DNA complementare)
  • RNA (acido ribonucleico)
  • cRNA (RNA complementare)
  • RNase (ribonucleasi)
  • DNase (desossiribonucleasi)
  • rRNA (RNA ribosomiale)
  • mRNA (RNA messaggero)
  • tRNA (RNA transfer)
  • AMP, ADP, ATP, dAMP, ddATP, e GTP, ecc. (per i rispettivi 5′ fosfati di adenosina e altri nucleosidi) (aggiungere 2′-, 3′-, o 5′- quando necessario per il contrasto)
  • ATPasi e dGTPasi, ecc. (adenosina trifosfatasi e deossiguanosina trifosfatasi, ecc.)
  • NAD (nicotinamide adenina dinucleotide)
  • NAD+ (nicotinamide adenina dinucleotide, ossidato)
  • NADH (nicotinamide adenina dinucleotide, ridotto)
  • NADP (nicotinammide adenina dinucleotide fosfato)
  • NADPH (nicotinammide adenina dinucleotide fosfato, ridotto)
  • NADP+ (nicotinammide adenina dinucleotide fosfato, ossidato)
  • poly(A) e poly(dT), ecc. (acido poliadenilico e acido polidossitimidilico, ecc.)
  • oligo(dT), ecc. (acido oligodeossitimidilico, ecc.)
  • UV (ultravioletto)
  • PFU (unità formanti placche)
  • CFU (unità formanti colonieforming units)
  • MIC (minimal inhibitory concentration)
  • Tris
  • DEAE (diethylaminoethyl)
  • EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid)
  • EGTA
  • HEPES (N-2-hydroxyethylpiperazine-N′-2-ethanesulfonic acid)
  • PCR (polymerase chain reaction)
  • AIDS (acquired immunodeficiency syndrome)

Abbreviations for cell lines (e.g., HeLa) also need not be defined.

The following abbreviations should be used without definition in tables:

  • amt (amount)
  • approx (approximately)
  • avg (average)
  • concn (concentration)
  • diam (diameter)
  • expt (experiment)
  • exptl (experimental)
  • ht (height)
  • mo (month)
  • mol wt (molecular weight)
  • no. (number)
  • prepn (preparation)
  • SD (standard deviation)
  • SE (standard error)
  • SEM (standard error of the mean)
  • sp act (specific activity)
  • sp gr (specific gravity)
  • temp (temperatura)
  • vol (volume)
  • vs (versus)
  • wk (settimana)
  • wt (peso)
  • yr (anno)

Relazione di dati numerici

Le unità metriche standard sono usate per riportare lunghezza, peso e volume. Per queste unità e per la molarità, usare i prefissi m, μ, n, e p per 10-3, 10-6, 10-9, e 10-12, rispettivamente. Allo stesso modo, usare il prefisso k per 103. Evitare prefissi composti come mµ o µµ. Usare µg/ml o µg/g al posto dell’ambiguo ppm. Le unità di temperatura sono presentate come segue: 37°C o 324 K.

Quando le frazioni sono usate per esprimere unità come le attività enzimatiche, è preferibile usare unità intere, come “g” o “min”, nel denominatore invece di unità frazionate o multiple, come µg o 10 min. Per esempio, “pmol/min” è preferibile a “nmol/10 min”, e “μmol/g” è preferibile a “nmol/μg”. È anche preferibile usare una forma non ambigua, come la notazione esponenziale; per esempio, “μmol g-1 min-1” è preferibile a “μmol/g/min”. Riportare sempre i dati numerici nelle unità SI appropriate.

Per una rassegna di alcuni errori comuni associati alle analisi statistiche e ai rapporti, più le linee guida su come evitarli, vedere gli articoli di Olsen (Infect Immun 71:6689-6692, 2003; Infect Immun 82:916-920, 2014).

Per una revisione delle considerazioni statistiche di base per gli esperimenti di virologia, vedi l’articolo di Richardson e Overbaugh (J Virol 79:669-676, 2005).

Composti marcati isotopicamente

Per le molecole semplici, l’etichettatura isotopica è indicata nella formula chimica (es, 14CO2, 3H2O, e H235SO4). Le parentesi non sono usate quando il simbolo isotopico è attaccato al nome di un composto che nel suo stato naturale non contiene l’elemento (ad esempio, 32S-ATP) o ad una parola che non è un nome chimico specifico (ad esempio, proteine marcate con 131I, 14C-aminoacidi, e 3H-ligandi).

Per sostanze chimiche specifiche, il simbolo per l’isotopo introdotto è posto tra parentesi quadre direttamente prima della parte del nome che descrive l’entità marcata. Si noti che i simboli di configurazione e i modificatori precedono il simbolo isotopico. I seguenti esempi illustrano l’uso corretto.

  • urea
  • L-metionina
  • serina
  • lisina
  • ATP
  • UDP-glucosio
  • DNA di E. coli
  • fruttosio 1,6-bisfosfato