National Library of Medicine (NLM)

• Missione
• Eventi importanti
• Cronologia legislativa
• Direttore
• Programmi

Missione

La National Library of Medicine è la più grande biblioteca biomedica del mondo e leader nella ricerca in informatica sanitaria computazionale. NLM gioca un ruolo fondamentale nel tradurre la ricerca biomedica in pratica. I servizi di ricerca e informazione di NLM supportano la scoperta scientifica, l’assistenza sanitaria e la salute pubblica. NLM è pioniere di nuovi modi per rendere i dati biomedici e le informazioni più accessibili; costruisce strumenti per una migliore gestione dei dati e per la salute personale; e aiuta a creare una forza lavoro più diversificata e qualificata dai dati. NLM consente ai ricercatori, ai medici e al pubblico di utilizzare la vasta ricchezza di dati biomedici per migliorare la salute.

La ricerca e i programmi di formazione all’avanguardia di NLM – con particolare attenzione all’intelligenza artificiale (AI), all’apprendimento automatico, alla biologia computazionale, all’informatica biomedica e agli standard dei dati sanitari – aiutano a catalizzare la scienza biomedica di base, la scoperta guidata dai dati e la fornitura di assistenza sanitaria.

Ogni giorno, milioni di scienziati, professionisti della salute e membri del pubblico di tutto il mondo utilizzano le risorse informative online di NLM per tradurre i risultati della ricerca in nuovi trattamenti, sviluppare nuovi prodotti, informare il processo decisionale clinico e migliorare la salute pubblica. Inoltre, NLM guida la ricerca e la formazione alla ricerca in informatica biomedica, scienza dell’informazione e scienza dei dati. I suoi vivaci programmi di ricerca intramurale ed extramurale conducono e sostengono la ricerca e la formazione nelle istituzioni di tutti gli Stati Uniti.

NLM fa parte dei National Institutes of Health (NIH), U.S. Department of Health and Human Services, e si trova a Bethesda, Maryland. NLM ha iniziato nel 1836 come una piccola collezione di libri e riviste mediche nell’ufficio dell’U.S. Army Surgeon General.

Facendo leva sulla sua storia di 184 anni, NLM sviluppa e applica approcci innovativi per acquisire, organizzare, curare e fornire informazioni biomediche negli Stati Uniti e nel mondo. I servizi avanzati di informazione biomedica di NLM sono tra i siti web più visitati del governo federale.

NLM svolge la sua missione di consentire la ricerca biomedica, sostenere l’assistenza sanitaria e la salute pubblica e promuovere un comportamento sano:

• acquisendo, organizzando, conservando e fornendo accesso online gratuito alla letteratura biomedica accademica di tutto il mondo.
• Fornendo l’accesso alle informazioni biomediche e sanitarie in tutto il paese in collaborazione con gli oltre 8.100 membri del National Network of Libraries of Medicine (NNLM).
• Servendo come una risorsa leader a livello mondiale per costruire, curare e fornire un accesso sofisticato alla biologia molecolare e genomica, agli studi clinici, alla salute ambientale e ad altri tipi di dati biomedici, compresi quelli provenienti da iniziative di alto profilo e trans-NIH.
• Condurre la ricerca e lo sviluppo sui sistemi, i metodi, le tecnologie e le reti di comunicazione biomedica e la diffusione e l’utilizzo delle informazioni tra gli operatori sanitari, i pazienti e il pubblico.
• Finanziare l’informatica biomedica avanzata e la ricerca sulla scienza dei dati e servire come il principale sostenitore della formazione di ricerca pre- e post-dottorato in informatica biomedica e scienza dei dati in 16 università statunitensi.

Eventi importanti nella storia della NLM

1836-Biblioteca dell’Ufficio del Chirurgo Generale dell’Esercito (l’attuale Biblioteca Nazionale di Medicina) fondata.

1865-John Shaw Billings, MD, nominato per supervisionare la Biblioteca del Chirurgo Generale, che ha sviluppato in una risorsa nazionale di letteratura biomedica. Fu direttore fino al 1895.

1879-Primo volume dell’Index Medicus, il primo tentativo di identificare e codificare la letteratura medica, pubblicato.

1880-Primo volume dell’Index-Catalogue, una bibliografia stampata in più parti.

1922-Biblioteca dell’Ufficio del Chirurgo Generale (Esercito) rinominata Army Medical Library.

1952-Army Medical Library rinominata Armed Forces Medical Library.

1956-Atto del Congresso sposta la Armed Forces Medical Library all’U.S. Public Health Service (PHS) e la rinomina National Library of Medicine.

1961-Nuovo edificio della National Library of Medicine, #38 (8600 Rockville Pike, Bethesda, Maryland, nel campus NIH), dedicato.

1964-Medical Literature Analysis and Retrieval System (MEDLARS), un sistema basato su computer per i professionisti medici per recuperare informazioni biomediche, diventa operativo alla NLM.

1965-Medical Library Assistance Act diede a NLM la responsabilità di aiutare le biblioteche mediche della nazione attraverso un programma di sovvenzioni e creò il Regional Medical Library Network (ora National Network of Libraries of Medicine).

1968-NLM divenne una componente di NIH. Il Lister Hill National Center for Biomedical Communications, la componente di ricerca e sviluppo del NLM, creato dal Congresso.

1971-MEDLINE (“MEDLARS Online”) iniziò a fornire accesso online a un sottoinsieme di riferimenti nel database MEDLARS.

1972-TOXLINE, un servizio bibliografico online che copre la farmacologia e la tossicologia, divenne operativo.

1980-Il Lister Hill National Center for Biomedical Communications, edificio #38A, fu dedicato. Adiacente alla Biblioteca, ospita le componenti di ricerca e sviluppo del NLM.

1986-Grateful Med, un software di facile utilizzo per l’accesso a MEDLARS, presentato alla comunità sanitaria.

1988-Il National Center for Biotechnology Information (NCBI) istituito al NLM dal Congresso come risorsa nazionale per le informazioni di biologia molecolare.

1992-NCBI ha assunto la responsabilità di GenBank e la partecipazione degli Stati Uniti al Consorzio Internazionale di Sequenze Nucleotidiche.

1993-National Information Center on Health Services Research and Health Care Technology istituito presso l’NLM dal Congresso come risorsa nazionale per la ricerca sui servizi sanitari e le linee guida sulle pratiche basate sull’evidenza.

1993-Nasce il sito web dell’NLM (www.nlm.nih.gov).

1994-Il Visible Human Male, un grande dataset di immagini al computer basato su un cadavere, viene introdotto. Il Visible Human Female apparve un anno dopo.

1997-L’accesso al database MEDLINE/PubMed di NLM divenne gratuito attraverso il World Wide Web.

1998-MedlinePlus fu rilasciato, fornendo l’accesso alle informazioni sanitarie dei consumatori.

2000-ClinicalTrials.gov, una risorsa online per dare al pubblico un facile accesso alle informazioni sugli studi di ricerca.

2000-PubMed Central (PMC), un archivio gratuito di riviste biomediche e di scienze della vita, lanciato.

2002-NLM ha lanciato un programma di mostre storiche itineranti con la pubblicazione di Frankenstein: Penetrating the Secrets of Nature.

2003-NLM ha rilasciato il formato standard per l’archiviazione elettronica e la pubblicazione di articoli di giornale – il journal article tagging suite o JATS, che in seguito è diventato uno standard nazionale.

2004-Il Segretario di HHS ha designato NLM come HHS Coordinating Body for Clinical Terminology Standards.

2006-NIH MedlinePlus magazine lanciato per fornire agli americani informazioni sanitarie affidabili e attuali in un formato adatto ai consumatori. La versione spagnolo-inglese, Salud, è seguita due anni dopo.

2006-dbGaP, il database dei genomi e dei fenomi, lanciato per fornire l’accesso agli studi di associazione genome-wide.

2006-DailyMed ha reso le etichette elettroniche dei prodotti strutturati (foglietti illustrativi dei farmaci) approvate dalla FDA disponibili al pubblico e agli sviluppatori del sistema.

2008-La politica di accesso pubblico dell’NIH, che richiede il deposito in PMC degli articoli peer-reviewed risultanti dalla ricerca finanziata dall’NIH, è diventata obbligatoria, come specificato nella legge sugli stanziamenti del 2008.

2008-Il deposito dei dati dei risultati riassuntivi in ClinicalTrials.gov è diventato obbligatorio per determinati studi clinici di farmaci e dispositivi regolati dalla FDA, come specificato nell’FDA Amendments Act del 2007.

2010-MedlinePlus Connect, un servizio che collega i pazienti o i fornitori nei sistemi di cartelle cliniche elettroniche (EHR) alle relative informazioni MedlinePlus su condizioni o farmaci, è stato rilasciato.

2010-Le norme del vocabolario supportate o sviluppate da NLM (LOINC, RxNorm, SNOMED CT) sono state incluse nella regola che specifica i criteri di certificazione degli Stati Uniti per i sistemi di cartelle cliniche elettroniche.

2015-AccessGUDID ha reso disponibili al pubblico le informazioni sui dispositivi medici presentate alla FDA.

2015-Altre agenzie HHS e altri dipartimenti federali hanno scelto di richiedere il deposito in PMC delle pubblicazioni risultanti dalle loro ricerche finanziate.

2016-Patricia Flatley Brennan, RN, PhD, è diventata la prima donna e la prima infermiera nominata a capo della Biblioteca.

2017-HHS ha emesso la regola finale per la registrazione e la segnalazione di risultati sintetici di studi clinici su ClinicalTrials.gov. NIH ha emesso una politica che estende i requisiti a tutti gli studi clinici finanziati da NIH.

2017-NLM ha lanciato il suo piano strategico 2017-2027: una piattaforma per la scoperta biomedica e la salute alimentata dai dati

2019-NIH MedlinePlus magazine è diventato disponibile online in inglese e spagnolo.

2019-I dati pubblici del Sequence Read Archive (SRA) del NIST si sono spostati sul cloud, completando la prima fase di uno sforzo continuo per posizionare meglio questi dati per il calcolo su larga scala.

2020-NLM ha lanciato una versione aggiornata di PubMed, fornendo un design e una tecnologia migliorati per migliorare l’esperienza dell’utente.

Cronologia legislativa di NLM

3 agosto 1956-Un emendamento al titolo III del Public Health Service Act, il National Library of Medicine Act, ha posto la Armed Forces Medical Library sotto il PHS e l’ha rinominata National Library of Medicine (Public Law 84-941).

Il 22 ottobre 1965-Il Medical Library Assistance Act del 1965 (Public Law 89-291) autorizzò i programmi extramurali di assistenza a fondo perduto della NLM per aiutare ad espandere e migliorare la biblioteca medica della nazione e le risorse di comunicazione sanitaria, la tecnologia e lo staff professionale per il servizio alla comunità sanitaria.

3 agosto 1968-La legge pubblica 90-456 ha autorizzato la designazione del Lister Hill National Center for Biomedical Communications.

4 novembre 1988-Health Omnibus Programs Extension Act (Public Law 100-607) ha autorizzato la creazione del National Center for Biotechnology Information presso NLM.

10 giugno 1993-National Institutes of Health Revitalization Act (Public Law 103-43) ha autorizzato la creazione del National Information Center on Health Services Research and Health Care Technology presso NLM.

Novembre 21, 1997-La Food and Drug Administration Modernization Act (Public Law 105-115) ha richiesto la creazione di un elenco online centralizzato e di facile consultazione dei trial clinici, che è diventato ClinicalTrials.gov.

September 27, 2007-The Food and Drug Administration Amendments Act (Public Law 111-85) ha esteso lo scopo dei trial clinici da registrare su ClinicalTrials.gov e ha esteso la banca dati per includere i risultati riassuntivi dei trial clinici completati.

Schizzo biografico del direttore del NLM Patricia Flatley Brennan, RN, PhD

Patricia Flatley Brennan, RN, PhD, è il direttore della National Library of Medicine, la più grande biblioteca biomedica del mondo.

Da quando è diventata direttrice nell’agosto 2016, la dottoressa Brennan ha posizionato la Biblioteca per essere il fulcro della scienza dei dati biomedici al NIH e in tutta l’impresa di ricerca biomedica a livello globale. Ha guidato lo sviluppo di un piano strategico che migliora la ricerca, lo sviluppo, la formazione e i sistemi informativi di NLM.

Facendo leva sui dati e sulle risorse informative di NLM, sulla ricerca intramurale e sui programmi di ricerca e formazione extramurale, la dottoressa Brennan sta rafforzando e facendo avanzare l’infrastruttura di dati di NLM per accelerare la scoperta e la salute guidata dai dati, coinvolgere nuovi utenti in modi nuovi e sviluppare la forza lavoro per un futuro guidato dai dati.

La dottoressa Brennan è un pioniere nello sviluppo di sistemi e servizi informatici innovativi. I suoi risultati professionali riflettono il suo background, che unisce l’ingegneria, l’informatica e la cura clinica per migliorare la salute pubblica e garantire la migliore esperienza possibile nella cura dei pazienti. La dottoressa Brennan ha una nomina come ricercatore associato nell’Istituto Nazionale di Ricerca Infermieristica Divisione di Ricerca Intramurale, dove dirige il Laboratorio di Visualizzazione Avanzata.

La dottoressa Brennan è arrivata al NIH dall’Università del Wisconsin-Madison, dove è stata Professore Lillian L. Moehlman Bascom presso la Scuola di Infermieristica e il College of Engineering dell’Università del Wisconsin-Madison. Ha anche guidato il Living Environments Laboratory (ora il Virtual Environments Group) al Wisconsin Institute for Discovery.

Ha ricevuto un Master of Science in infermieristica dall’Università della Pennsylvania e un PhD in ingegneria industriale dall’Università del Wisconsin-Madison. Dopo la pratica clinica nell’assistenza infermieristica critica e psichiatrica, la dottoressa Brennan ha ricoperto posizioni accademiche presso la Marquette University, Milwaukee; la Case Western Reserve University, Cleveland; e l’Università del Wisconsin-Madison.

Un ex presidente dell’American Medical Informatics Association, la dottoressa Brennan è stata eletta alla National Academy of Medicine nel 2001. È membro dell’American Academy of Nursing, dell’American College of Medical Informatics e della New York Academy of Medicine.

Nel 2020, la dottoressa Brennan è stata inserita nell’American Institute for Medical and Biological Engineering (AIMBE). L’AIMBE College of Fellows è tra le più alte distinzioni professionali accordate a un ingegnere medico e biologico.

È disponibile una bibliografia selezionata. Potete saperne di più sulla dottoressa Brennan attraverso il suo blog, Musings from the Mezzanine, e il suo account Twitter: @NLMdirettore.

NLM Directors

Name	In Office from	To
Leon Lloyd Gardner
Joseph Hamilton McNinch
Frank Bradway Rogers
Martin Marc Cummings
Donald A.B. Lindberg
Betsy L. Humphreys (Acting)
Patricia Flatley Brennan	2016	Present

Major Divisions

NLM’s Extramural Programs Division offers grant support for research projects and research training in biomedical informatics and data science. L’informatica biomedica e la ricerca sulla scienza dei dati sviluppano metodi e approcci per migliorare l’acquisizione, l’integrazione, la gestione, l’analisi, la visualizzazione, il recupero e l’uso di informazioni e dati biomedici e comportamentali relativi alla salute umana. La Divisione Programmi Extramurali fornisce supporto alla ricerca sia per la ricerca di base che per quella applicata in queste aree e in quelle correlate.

Per espandere la forza lavoro biomedica nell’area dell’informatica biomedica e della scienza dei dati, NLM supporta la formazione in informatica biomedica presso istituzioni educative in tutti gli Stati Uniti. Questi programmi offrono formazione pre-dottorato e post-dottorato per carriere di ricerca in informatica sanitaria, scienza dei dati biomedici, informatica traslazionale, informatica della ricerca clinica, informatica della sanità pubblica e aree correlate. Inoltre, vengono offerte borse di studio individuali pre-dottorato in informatica biomedica o scienza dei dati, così come premi per la transizione di carriera.

Le sovvenzioni sono anche fatte alle piccole imprese statunitensi che cercano di intraprendere la ricerca e lo sviluppo dell’informatica che portano alla commercializzazione. Le aree di ricerca critiche includono l’aiuto ai consumatori nella visualizzazione dei dati sanitari, l’integrazione dei dati di grandi risorse di dati disparati, le tecniche di intelligenza artificiale per le risorse di dati biomedici e il miglioramento dei dati biomedici, compresi i dati sanitari personali, per consentire l’accesso ai dati a più di un utente allo stesso tempo. NLM partecipa anche alle iniziative NIH per le piccole imprese relative all’adozione dello standard Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) per lo scambio di informazioni sanitarie elettroniche, e alla ricerca di terapie e tecniche migliori per migliorare la misurazione e il trattamento del dolore a sostegno dell’iniziativa NIH Helping to End Addiction Long-term (HEAL).

La Divisione Programmi Extramurali ha due programmi unici per sostenere lo sviluppo di risorse informative per aiutare a ridurre le disparità sanitarie e lo sviluppo di risorse relative alla storia e alla filosofia della medicina e della salute pubblica.

NLM è leader nella formazione alla ricerca in informatica biomedica, biologia computazionale e scienza dei dati. NLM sostiene 200 tirocinanti pre- e post-dottorato all’anno in informatica biomedica e scienza dei dati in 16 programmi universitari in tutto il paese. Questi programmi incoraggiano le applicazioni da persone tradizionalmente sottorappresentate nell’informatica biomedica e nella ricerca; undici dei programmi offrono una formazione estiva speciale a breve termine per migliorare il reclutamento. Nell’anno fiscale 2019, NLM ha collaborato con la National Science Foundation per coinvolgere esperti di ricerca della scienza dei dati con ricercatori biomedici che studiano e sviluppano metodi analitici avanzati applicati alla salute.

Tutti i programmi di sovvenzione attivi di NLM, gli elenchi dei recenti premiati e le informazioni di contatto per il personale delle sovvenzioni sono forniti a https://www.nlm.nih.gov/ep/.

Divisione delle Operazioni di Biblioteca (LO)

La Divisione delle Operazioni di Biblioteca acquisisce, organizza, conserva e fornisce l’accesso alla Collezione NLM, che rappresenta il contenuto intellettuale e la diversità della letteratura biomedica mondiale, i dati e altri oggetti e informazioni di ricerca. Queste attività sono guidate dalla NLM Collection and Preservation Policy approvata dal NLM Board of Regents nel 2019. LO crea e diffonde anche vocabolari controllati tra cui MeSH, UMLS e RxNorm, e uno schema di classificazione della biblioteca. LO è la sede del National Information Center on Health Services Research and Health Care Technology, che fornisce risorse come HSRProj, un database di progetti di ricerca sui servizi sanitari.

LO produce autorevoli record di indicizzazione e catalogazione e costruisce e distribuisce banche dati bibliografiche, elenchi e full-text, tra cui MEDLINE attraverso PubMed e DailyMed.

NLM utilizza molteplici canali per raggiungere il pubblico, tra cui siti web a misura di consumatore, contatto diretto e reti comunitarie. Informazioni affidabili e autorevoli sulla salute dei consumatori sono disponibili attraverso MedlinePlus, MedlinePlus en español, e MedlinePlus Connect, un servizio gratuito che collega i portali dei pazienti e le cartelle cliniche elettroniche alle informazioni sulla salute dei consumatori.

LO è anche sede del NIH Common Data Element Repository, parte di un’iniziativa a livello NIH per incoraggiare gli standard dei dati sanitari nella ricerca clinica e nei registri dei pazienti. LO fornisce la consegna dei documenti, principalmente attraverso il sistema NLM DOCLINE, e un servizio clienti che aiuta le persone a utilizzare efficacemente le collezioni e le risorse NLM.

La Divisione Storia della Medicina raccoglie, conserva, rende disponibile e interpreta la più ricca collezione al mondo di materiali storici, che vanno dall’11° al 21° secolo, sia in formato fisico che digitale, compreso un programma di mostre storiche e un blog chiamato Circulating Now.

L’Office of Engagement and Training (OET) del NIH, sede del National Network of Libraries of Medicine (NNLM), coinvolge più di 8.100 biblioteche accademiche, ospedaliere e pubbliche, e organizzazioni comunitarie in tutti gli Stati Uniti per migliorare l’accesso alle informazioni sanitarie. In collaborazione con il programma di ricerca All of Us di NIH, NNLM coinvolge le comunità che sono sottorappresentate nella ricerca biomedica per fornire informazioni sulla medicina di precisione. NNLM aumenta anche la capacità di scienza dei dati delle biblioteche di ricerca e dei bibliotecari per gestire e analizzare i dati biomedici. OET coordina la formazione, l’impegno e la costruzione di capacità sulle offerte NLM per gli stakeholder prioritari e il pubblico.

Programma di ricerca intramurale

NLM conduce ricerche pionieristiche per far progredire la conoscenza nell’informatica biomedica, nella biologia computazionale e nella scienza dei dati. Il NLM Intramural Research Program riunisce il Lister Hill National Center for Biomedical Communications e il National Center for Biotechnology Information’s (NCBI) Computational Biology Branch.

Il portafoglio di ricerca del NLM comprende l’intelligenza artificiale, la biologia computazionale, il supporto alle decisioni cliniche e la sorveglianza della salute pubblica. La ricerca di NLM produce nuovi approcci analitici e strumenti di visualizzazione che aiutano gli scienziati ad accelerare la scoperta dai dati e a tradurre i risultati in soluzioni cliniche. Questa ricerca contribuisce a una comprensione più profonda degli effetti di farmaci, procedure e altri fattori che influenzano la salute umana e la prevenzione e il trattamento delle malattie. NLM produce strumenti che rendono le scoperte e i dati sanitari più comprensibili per i pazienti e aiuta le persone ad accedere, memorizzare, utilizzare e comprendere i propri dati sanitari.

NLM supporta la ricerca nell’elaborazione del linguaggio medico, l’accesso ad alta velocità alle informazioni biomediche, l’analisi e l’uso di dati di imaging biomedico di alta qualità e l’analisi su larga scala dei dati clinici e amministrativi per prevedere i risultati dei pazienti. Il suo lavoro ha convalidato i risultati della ricerca clinica, ha aiutato a localizzare e identificare i virus che rappresentano una minaccia per la salute pubblica, e ha migliorato l’apprendimento automatico e l’elaborazione delle immagini per lo screening del cancro alla cervice e l’assistenza nel trattamento precoce. La ricerca di biologia computazionale di NLM crea nuovi modi per rappresentare e collegare i dati genomici e biologici con la letteratura biomedica e far progredire la comprensione della genomica evolutiva. NLM produce strumenti software analitici per ottenere intuizioni sui modelli mutazionali genetici e sui fattori di malattia, sul legame molecolare e sulla struttura e funzione delle proteine.

NLM ospita anche borsisti di ricerca post-dottorato che applicano la scienza informatica alla ricerca, all’istruzione e alla cura clinica.

Lister Hill National Center for Biomedical Communications (LHNCBC)

Il Congresso ha istituito il Lister Hill Center for Biomedical Communications nel 1968 per migliorare la comunicazione sull’educazione sanitaria, la ricerca e la pratica. Oggi, LHNCBC si concentra sul miglioramento della salute attraverso i progressi metodologici nella scienza e nell’informatica dei dati sanitari. Le attività di LHNCBC sono incentrate sui dati clinici e mirano a produrre dati interoperabili, metodi scalabili e la traduzione delle scoperte della ricerca in operazioni.

Oltre a contribuire al NLM Intramural Research Program, il personale di LHNCBC traduce le intuizioni della ricerca in prodotti e servizi offerti al pubblico (es, Open-i®, un motore di ricerca di immagini biomediche ad accesso aperto) e alla comunità di ricerca (ad esempio, NLM Scrubber, un pacchetto software per la de-identificazione del testo clinico) o per l’uso nelle operazioni NLM (ad esempio, il Medical Text Indexer, uno strumento che produce raccomandazioni di indicizzazione per le citazioni MEDLINE). LHNCBC ha una lunga tradizione di applicazione di tecniche di intelligenza artificiale alle immagini cliniche per scopi diagnostici o prognostici. Gli esempi includono l’identificazione dei parassiti della malaria negli strisci di sangue, la classificazione delle radiografie del torace per la tubercolosi, e l’individuazione e la stadiazione del cancro cervicale da fotografie della cervice uterina e immagini istologiche. Lo staff del LHNCBC guida anche lo sviluppo, il miglioramento e l’adozione del vocabolario clinico (per esempio, SNOMED CT, LOINC e RxNorm) e degli standard dei modelli informativi, con particolare attenzione allo standard HL7 FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) per lo scambio di informazioni cliniche.

National Center for Biotechnology Information (NCBI)

Il Congresso ha istituito il National Center for Biotechnology Information nel 1988 come una divisione del NLM e come risorsa nazionale per le informazioni di biologia molecolare. Da allora, l’NCBI è stata una fonte leader per i database biomedici pubblici, gli strumenti software per l’analisi dei dati molecolari e genomici, e la ricerca in biologia computazionale

NCBI crea e mantiene oltre 40 database per la comunità medica e scientifica e per il pubblico in generale; questi includono database di letteratura, molecolari e genomici. Il principale database di letteratura dell’NCBI è PubMed, che fornisce abstract e citazioni per milioni di articoli da migliaia di riviste biomediche. I record di PubMed includono link alle versioni full-text degli articoli (quando disponibili) dall’archivio elettronico PubMed Central (PMC) dell’NCBI e dai siti web delle riviste, così come link a informazioni correlate da altri siti NCBI, come i database genomici e molecolari.

Alcune delle risorse genomiche e genetiche principali dell’NCBI includono GenBank, una collezione annotata di tutte le sequenze di DNA disponibili al pubblico; RefSeq, una collezione curata di sequenze di DNA, RNA e proteine; il Sequence Read Archive (SRA), che ospita dati di sequenziamento ad alta produttività; dbSNP, un database di brevi variazioni genetiche (aree del genoma che sono state trovate per variare tra gli esseri umani); dbGaP, un database che collega i dati del genotipo e del fenotipo dagli studi di associazione genome-wide (GWAS) e da altri studi; ClinVar, una raccolta di relazioni riportate tra le variazioni genetiche e lo stato di salute osservato; il registro dei test genetici, un database di test genetici; e la risorsa Pathogen Detection, che integra i dati di sequenza per i patogeni batterici ottenuti da cibo, ambiente e pazienti umani per facilitare la sorveglianza attiva e in tempo reale dei patogeni e delle malattie di origine alimentare. NCBI produce anche ClinicalTrials.gov, un database di studi clinici finanziati privatamente e pubblicamente condotti in tutto il mondo. Altri database includono informazioni sulle strutture chimiche e le loro attività biologiche, sequenze proteiche, struttura delle proteine, aberrazioni cromosomiche nel cancro, geni ed espressione genica, tassonomia e altro ancora.

Office of Computer and Communications Systems (OCCS)

L’Office of Computer and Communications Systems fornisce servizi informatici e consulenza tecnica per sostenere i programmi di ricerca e gestione offerti attraverso NLM. L’OCCS gestisce e fa funzionare la dorsale di rete dell’NLM, le connessioni alle reti Internet e Internet2, le reti informatiche interne all’NLM, le strutture di data center onsite e offsite dell’NLM, le piattaforme per il calcolo e lo stoccaggio aziendale, le piattaforme per il calcolo degli utenti finali e le tecnologie di accesso remoto e degli utenti mobili.

L’OCCS sviluppa e gestisce servizi informatici e applicazioni software che supportano la missione della Biblioteca. L’OCCS sviluppa applicazioni sia per uso interno che pubblico, con competenze specifiche nello sviluppo di applicazioni software che utilizzano la terminologia medica standardizzata.

L’OCCCS fornisce supporto ai clienti, formazione e documentazione per gli utenti di computer e rete. Inoltre, OCCS sviluppa standard e linee guida per la gestione e l’utilizzo delle tecnologie dell’informazione presso NLM in conformità con le migliori pratiche del settore e i mandati del governo federale applicabili. L’OCCS fornisce la supervisione di tutti i programmi di sicurezza delle informazioni di NLM e garantisce che i sistemi informativi di NLM siano conformi agli standard federali di sicurezza delle informazioni.

Come chief information officer di NLM, il direttore dell’OCCS approva le acquisizioni relative alle tecnologie dell’informazione, supervisiona il processo di governance per gli investimenti di NLM nelle tecnologie dell’informazione e garantisce che NLM sia conforme alle leggi, alle direttive e agli standard federali pertinenti.