国立医学図書館（NLM）

Patricia Flatley Brennan, RN, PhDNLM

Patricia Flatley Brennan, RN, PhDは、世界最大の生物医学図書館であるNational Library of Medicineのディレクターを務めています。

2016年8月に所長に就任して以来、ブレナン博士は図書館をNIHおよび世界の生物医学研究企業全体の生物医学データサイエンスのハブとなるよう位置づけています。 NLMの研究、開発、トレーニング、情報システムを強化する戦略計画の策定を率先しました。

ブレナン博士は、NLMのデータと情報リソース、学内研究、学外研究・トレーニングプログラムを活用し、データ駆動型の発見と健康を加速させ、新しいユーザーと新しい方法で関わり、データ駆動型の未来のための労働力を開発するために、NLMのデータ基盤を強化・発展させようとしています。

ブレナン博士は、革新的な情報システムやサービスの開発におけるパイオニアであり、その専門的な業績は、公衆衛生を改善し、患者ケアにおける最高の経験を確保するために、エンジニアリング、情報技術、臨床ケアを融合させた彼女の経歴を反映しています。

ブレナン博士は、ウィスコンシン大学マディソン校の看護学部および工学部の Lillian L. Moehlman Bascom 教授から NIH にやってきました。

ペンシルベニア大学で看護学の修士号を、ウィスコンシン大学マディソン校で産業工学の博士号を取得しています。

米国医療情報学会の元会長であるブレナン博士は、2001年に米国医学アカデミーに選出されました。

2020年、ブレナン博士は、米国医学・生物工学協会（AIMBE）の会員になりました。 AIMBE College of Fellowsは、医学・生物学エンジニアに与えられる専門家としての最高の栄誉の一つです

厳選した書誌を掲載しています。 ブレナン博士については、ブログ「Musing from the Mezzanine」やTwitterアカウントで詳しく知ることができます。 NLMdirector をご覧ください。

NLM Directors

Major Divisions

NLM’s Extramural Programs Division offers grant support for research projects and research training in biomedical informatics and data science. バイオメディカルインフォマティクスとデータサイエンス研究は、人間の健康に関する生物医学的および行動学的情報とデータの取得、統合、管理、分析、可視化、検索、利用を改善するための方法とアプローチを開発するものです。

生物医学情報学とデータサイエンスの分野で生物医学の人材を拡大するため、NLMは米国中の教育機関で生物医学情報学のトレーニングを支援しています。これらのプログラムは、ヘルスケア情報学、生物医学データ科学、トランスレーショナル情報学、臨床研究情報学、公衆衛生情報学および関連分野の研究キャリアのためのプレドクトラルおよびポストドクトラル教育を提供しています。

さらに、生物医学情報学やデータサイエンスにおける個人のプレドクトラルフェローシップや、キャリア転換賞も提供されています。 重要な研究分野には、消費者による健康データの視覚化の支援、大規模な異種データリソースのデータ統合、生物医学データリソースのための人工知能技術、複数のユーザーのデータに同時にアクセスできるようにするための個人健康データを含む生物医学データの拡張などがあります。 NLMはまた、電子医療情報を交換するための高速医療相互運用性リソース（FHIR）標準の採用に関するNIHの中小企業向けイニシアチブに参加し、NIHのHelping to End Addiction Long-term (HEAL) Initiativeを支援して痛みの測定と治療を強化するための治療法と技術の改善を求めています。

学外プログラム部門には、健康格差の是正に役立つ情報資源の開発と、医学と公衆衛生の歴史と哲学に関連する資源の開発を支援する、2つのユニークなプログラムがあります。

NLMは、生物医学情報学、計算生物学、データ科学における研究訓練のリーダー的存在です。

NLMは、生物医学情報学、計算生物学、データサイエンスにおける研究トレーニングのリーダーです。 これらのプログラムでは、生物医学情報学や研究において伝統的に存在感の薄い人々からの応募を奨励しており、11のプログラムでは採用を促進するために特別な短期夏季研修を実施しています。 2019年度、NLMは全米科学財団と提携し、健康に適用される高度な分析方法を研究・開発する生物医学研究者にデータサイエンス研究の専門家を従事させました。

NLMのすべての活動中の助成プログラム、最近の受賞者のリスト、助成担当者の連絡先はhttps://www.nlm.nih.gov/ep/ で提供されています。

Division of Library Operations (LO)

図書館運営部門は、世界の生物医学文献、データ、その他の研究対象や情報の知的コンテンツと多様性を表すNLMコレクションの取得、整理、保存、利用を提供します。 これらの活動は、2019年にNLM理事会により承認された「NLMコレクションと保存に関する方針」によって指導されています。 LOはまた、MeSH、UMLS、RxNormなどの統制された語彙や、図書館分類スキームを作成し、普及させています。 LOは、医療サービス研究および医療技術に関する国立情報センターの拠点であり、医療サービス研究プロジェクトのデータベースであるHSRProjなどのリソースを提供しています。

LOは権威ある索引および目録記録を作成し、PubMedおよびDailyMedを通じてMEDLINEなどの書誌、ディレクトリ、全文データベースを構築・配布しています。

NLMでは複数のチャネルを使って、消費者に優しいウェブサイト、直接接触、コミュニティネットワークなど一般市民に到達するための手段を講じています。

LOはまた、臨床研究および患者登録における健康データの標準化を奨励するNIH全体の取り組みの一部であるNIH Common Data Element Repositoryの拠点でもあります。

医学史部門は、11世紀から21世紀にわたる世界で最も豊富な歴史的資料のコレクションを、物理的およびデジタル形式で収集、保存、利用、解説しており、歴史展示プログラムやCirculating Nowというブログも提供しています。

NLMのOffice of Engagement and Training（OET）は、National Network of Libraries of Medicine（NNLM）の拠点であり、健康情報へのアクセスを改善するために、米国内の8100以上の学術医療科学図書館、病院や公共図書館、地域団体に働きかけています。 NNLMは、NIHのAll of Us Research Programと連携し、生物医学研究に十分な参加者がいないコミュニティに対して、精密医療に関する情報を提供しています。 また、NNLMは研究図書館や図書館員が生物医学データを管理・分析するためのデータサイエンス能力を向上させる活動も行っています。

学内研究プログラム

NLMは、生物医学情報学、計算生物学、データサイエンスにおける知識を進歩させるため、先駆的な研究を行っています。

NLMの研究ポートフォリオには、人工知能、計算生物学、臨床決定支援、公衆衛生監視などがあります。 NLMの研究は、科学者がデータからの発見を加速し、発見を臨床的解決につなげるための、新しい分析アプローチと可視化ツールを生み出しています。 この研究は、人間の健康や病気の予防と治療に影響を与える薬物、処置、その他の要因の効果についてのより深い理解に貢献するものです。 NLMは、発見や健康データを患者がより理解しやすいようにするツールを作成し、人々が自身の健康データにアクセス、保存、使用、理解できるよう支援しています。

NLMは、医療言語処理、生物医学情報への高速アクセス、高品質の生物医学画像データの分析と使用、患者の転帰を予測するための臨床および行政データの大規模分析における研究を支援しています。 その研究により、臨床研究からの発見を検証し、公衆衛生に脅威を与えるウイルスの位置と特定を助け、子宮頸がんのスクリーニングと早期治療のための機械学習と画像処理を強化しました。 NLMの計算生物学研究は、ゲノムおよび生物学的データを表現し、生物医学文献と結びつける新しい方法を生み出し、進化ゲノミクスの理解を前進させています。

NLMはまた、情報科学の研究、教育、臨床ケアへの適用を行う博士研究員も受け入れています。

Lister Hill National Center for Biomedical Communications (LHNCBC)

米国議会は1968年に、健康教育、研究、実践に関するコミュニケーションを改善するために、Lister Hill Center for Biomedical Communicationsを設立しました。 今日、LHNCBCは健康データ科学と情報学の方法論の進歩を通じて健康を改善することに重点を置いています。 LHNCBCの活動は臨床データを中心とし、相互運用可能なデータ、拡張可能な方法、研究発見の業務への転換を生み出すことを目指しています。

NLM学内研究プログラムへの貢献に加えて、LHNCBCスタッフは研究の洞察を一般向けに提供する製品やサービス（例:, オープンアクセスの生物医学画像検索エンジン Open-i®）、研究コミュニティ（臨床テキストを非識別化するソフトウェアパッケージ NLM Scrubber など）、または NLM 業務（MEDLINE 引用に対するインデックス作成推奨事項を作成するツール Medical Text Indexer など）に提供される製品やサービスに、研究の洞察を反映させています。 LHNCBCは、診断や予後の目的で臨床画像に人工知能技術を適用する長い伝統を持っている。 例えば、血液塗抹標本に含まれるマラリア原虫の同定、胸部X線写真の結核分類、子宮頸部写真と組織画像からの子宮頸がんの検出と病期分類などである。 LHNCBC のスタッフはまた、臨床情報を交換するための HL7 FHIR 標準 (Fast Healthcare Interoperability Resources) を中心に、臨床用語 (SNOMED CT、LOINC、RxNorm など) や情報モデルの標準の開発、強化、採用を主導しています。

National Center for Biotechnology Information (NCBI)

議会は 1988 年に NLM 部門として、分子生物学情報のための国家リソースである National Center for Biotechnology Information を設置しました。 それ以来、NCBIは公開生物医学データベース、分子およびゲノムデータを分析するためのソフトウェアツール、計算生物学における研究のための主要な情報源となっています

NCBIは、医学および科学コミュニティだけでなく一般市民のために、文献、分子、ゲノムデータベースを含む40以上のデータベースを作成・維持しています。 NCBI の中核的な文献データベースは PubMed であり、数千の生物医学ジャーナルから数百万の論文の抄録と引用を提供しています。 このデータベースは、NCBIのPubMed Central (PMC) 電子アーカイブおよびジャーナルのウェブサイトから、論文の全文へのリンクと、ゲノムおよび分子データベースなど、NCBIの他のサイトからの関連情報へのリンクが含まれています。

NCBIの中核的なゲノム・遺伝子資源には、一般に公開されているすべてのDNA配列の注釈付きコレクションであるGenBank、DNA、RNA、タンパク質配列の精選コレクションであるRefSeq、ハイスループット配列決定データを収容するSequence Read Archive（SRA）、短い遺伝子変異（ヒト間で異なることが分かっているゲノムの領域）のデータベースdbSNP、などがあります。 dbGaP, ゲノムワイド関連研究（GWAS）やその他の研究から得られた遺伝子型と表現型のデータを連結したデータベース, ClinVar, 遺伝子変異と観察された健康状態との関係報告集, 遺伝子検査のデータベースである Genetic Testing registry, そして病原体と食中毒の活発なリアルタイム監視のために食物、環境、ヒト患者から得られた細菌病原体の配列データを統合する Pathogen Detection resourceがあります。 NCBIはまた、世界中で行われた民間および公的資金による臨床試験のデータベースであるClinicalTrials.govを作成しています。

Office of Computer and Communications Systems (OCCS)

コンピュータおよびコミュニケーションシステム部門は、NLMを通じて提供される研究および管理プログラムをサポートするために、情報技術サービスおよび技術アドバイスを提供します。 OCCS は、NLM ネットワークバックボーン、インターネットおよび Internet2 ネットワークへの接続、NLM 内のコンピュータネットワーク、NLM のオンサイトおよびオフサイトデータセンター施設、エンタープライズ計算およびストレージ用プラットフォーム、エンドユーザー計算用プラットフォーム、モバイルユーザーおよびリモートアクセス技術を管理および運用しています

OCCSは図書館のミッションをサポートする IT サービスおよびソフトウェアアプリケーションを開発し運用を行っています。

OCCSは、コンピュータとネットワークのユーザーに対して、カスタマーサポート、トレーニング、ドキュメンテーションを提供し、内部および一般向けのアプリケーションを開発しています。 さらに、OCCSは、業界のベストプラクティスおよび適用される連邦政府の指令に従って、NLMの情報技術を管理および使用するための標準およびガイダンスを作成します。

OCCSのディレクターはNLMの最高情報責任者として、情報技術に関連する買収を承認し、NLMの情報技術への投資のガバナンスプロセスを監督し、NLMが関連する連邦法、指令、基準を遵守するよう徹底しています。