Allelfrekvens

Vad jag vill göra i den här videon är att utforska idén om allelfrekvens allelfrekvens och bara för att påminna om att en allel är en variant av en gen, du får en variant av genen G från din mamma och en annan variant av genen från din pappa, så när vi pratar om allelen pratar vi om den specifika varianten som du fick från din mamma. Vi har sett detta förut, men nu ska vi gräva lite djupare och för att hjälpa oss att förstå detta börjar vi med en ganska vanlig modell för detta och vi ska tänka på ögonfärg och detta är naturligtvis en mycket stor förenkling, men låt oss bara anta att när vi har en population där det bara finns två varianter av en gen för ögonfärg, låt oss först anta att det finns en ögonfärgsgen och lyssna det finns två varianter en variant en allelform för ögonfärg titta vi kommer att använda förkortningen stort B låt oss säga att det är allelen för brun brun brun ögonfärg och vi kommer att anta att denna är dominant den är dominant över den andra allelen nu den andra allelen vi kommer att anta är för blå ögonfärg och vi kommer att representera den med ett litet B så det är blå ögonfärg och vi kommer att anta att vi kommer att anta att detta är recessivt så återigen är detta en granskning av någon som har en av de stora B-allelerna de bruna allelerna det spelar ingen roll vad deras andra allel är kommer att vara eftersom det antingen kommer att vara en annan brun eller det kommer att vara en blå de kommer att vara där de kommer att visa bruna ögon så detta kommer att vara bruna ögon och detta kommer att vara bruna ögon eftersom det enda sättet att få blå ögon är att vara det enda sättet att få blå ögon är att vara homozygot för den recessiva för den recessiva allelen och allt detta är naturligtvis en översyn vi har sett det förut men låt oss nu tänka på allelfrekvensen och för att tänka på det kommer jag att sätta upp en mycket artificiellt liten population så låt oss säga att vår s-population har exakt två människor i den populationen har exakt två personer, person 1 och person 2, och låt oss säga att vi kan titta på deras DNA och räkna ut deras genotyper, så person 1 har en B-allel, en brun allel och en blå allel, och person 2 har två blå, två blå, två blå alleler. Eftersom vi känner till genotyperna i den här artificiellt lilla populationen kan vi nu börja fundera på allelfrekvenserna eller frekvensen av de olika allelerna. Vad tror du kommer att vara frekvensen, frekvensen av den bruna allelen i den här populationen och jag uppmuntrar dig att pausa den här videon och tänka på detta på egen hand, så jag antar att du har haft en chans att göra det, så du kanske frestas att säga: ”Åh, det ser ut som att en av två personer har det, kanske är det 50 %”, men det är inte rätt sätt att tänka på allelfrekvenser och allelfrekvenser, du vill gräva lite mer. lite djupare och titta på de individuella allelerna och när du tittar på det säger du att det finns fyra individuella alleler i den här populationen eller det finns fyra varianter i den här eller den här, det finns bokstavligen fyra kromosomer, jag antar att du kan säga att de bär på den genen i den här populationen, och av dem bär en av dem på en av dem är huvudledet B, huvudledet B, och så vi kan säga att det kommer att vara 0.25 eller 25 % så återigen 20 25 procent av generna för I color har den stora B-allelen har den bruna allelen nu kan vi göra samma sak vi kan ställa oss samma fråga för den lilla B-allelen hur stor andel av generna i denna population är kod för eller representerar den lilla B-allelen den blå allelen och återigen uppmanar jag er att pausa videon och tänka på det. Det finns fyra gener i populationen som kodar för ögonfärg, varav en två tre en två tre kodar för eller är den blå allelen med små bokstäver är den blå allelen med små bokstäver, så det är 0.75 eller 75 % 75 % av generna kodar för den blå allelen med små bokstäver, medan 25 är den bruna allelen, och jag vill verkligen understryka hur detta skiljer sig från t.ex. fenotypfrekvensen, om jag frågar dig hur många procent av de bruna-ögon personer med bruna ögon personer med bruna ögon så nu pratar jag om fenotyp vad skulle det vara, ja det finns två personer i populationen en av dem har bruna ögon så det blir hälften och på samma sätt om jag skulle fråga dig hur stor är procentandelen av personer som är blå-ögon så skulle det vara hälften, den här personen är en av de två personerna som har blå ögon, men allelfrekvensen vi gräver djupt eller vi tittar på genotyperna och vi säger att av de fyra av de fyra generna här är en av dem Big B-allelen så det är 25 % så 25 % av så 25 % av olia av genpopulationen kodar för är den bruna allelen och 75 % är den blå allelen och det här är verkligen viktigt att internalisera, för när vi väl har internaliserat det här så är det, som vi kommer att se, idén att det är i den härdiga-weinbergprincipen börjar bli mycket meningsfull och jag ska göra en liten föraning vi kan beteckna vi kan beteckna detta detta är bara en konvention som ofta används av den lilla bokstaven P och vi kan använda Q med liten bokstav Q för att beteckna frekvensen så P med liten bokstav P är frekvensen av den dominanta allelen med liten bokstav Q är frekvensen av den recessiva allelen men vad är vad som är sant här vad som är sant för P vad som är sant vad som kommer att vara sant för P plus Q vad som kommer att vara vad P plus Q kommer att vara lika med och jag uppmuntrar er att pausa videon igen och tänka på detta vad är detta vad är detta som kommer att vara lika med väl när vi började så sa vi att det bara finns två möjligheter det är ett av de antaganden vi antog vi antog vi antog Det finns bara två alleler i denna population och i typ av allelpopulationen för detta i genpopulationen för denna egenskap så frekvensen av de dominanta plus frekvensen av de recessiva kommer alla att ha en av dem också så om du adderar dessa två frekvenser så kommer det att behöva adderas till hundra hundra procent. Vi ser att de är 1/4 plus 3/4 är en är 1 är 1 eller 100% och 25% plus 75% är också 100% så vi kan säga att P plus Q är lika med hundra procent eller vi kan säga att P plus Q är lika med 1 är lika med en och så i nästa video kommer vi att börja från den till synes ganska enkla idén för att komma till en mer rikare och ganska snygg idé som uttrycks i den hårda-weinberg-ekvationen