Národní lékařská knihovna (NLM)

• Mise
• Důležité události
• Legislativní chronologie
• Ředitel
• Programy

Poslání

Národní lékařská knihovna je největší biomedicínská knihovna na světě a lídr ve výzkumu v oblasti výpočetní zdravotnické informatiky. NLM hraje klíčovou roli při převádění biomedicínského výzkumu do praxe. Výzkumné a informační služby NLM podporují vědecké objevy, zdravotní péči a veřejné zdraví. NLM je průkopníkem v nových způsobech zpřístupňování biomedicínských dat a informací, vytváří nástroje pro lepší správu dat a osobní zdraví a pomáhá vytvářet rozmanitější a datově kvalifikovanější pracovní sílu. NLM umožňuje výzkumným pracovníkům, lékařům a veřejnosti využívat obrovské množství biomedicínských dat ke zlepšení zdraví.

Nejmodernější výzkumné a vzdělávací programy NLM – se zaměřením na umělou inteligenci (AI), strojové učení, výpočetní biologii a biomedicínskou informatiku a standardy zdravotnických dat – pomáhají katalyzovat základní biomedicínskou vědu, objevy založené na datech a poskytování zdravotní péče.

Každý den využívají miliony vědců, zdravotníků a veřejnosti z celého světa online informační zdroje NLM k tomu, aby výsledky výzkumu převedli do nových léčebných postupů, vyvíjeli nové produkty, informovali o klinických rozhodnutích a zlepšovali veřejné zdraví. Kromě toho NLM vede výzkum a školení v oblasti biomedicínské informatiky, informační vědy a datové vědy. Její živé intramurální a extramurální výzkumné programy provádějí a podporují výzkum a školení v institucích po celých Spojených státech.

NLM je součástí Národních institutů zdraví (NIH) amerického ministerstva zdravotnictví a lidských služeb a sídlí v Bethesdě ve státě Maryland. NLM vznikla v roce 1836 jako malá sbírka lékařských knih a časopisů v kanceláři generálního chirurga americké armády.

S využitím své 184leté historie NLM vyvíjí a uplatňuje inovativní přístupy k získávání, organizaci, kurátorství a poskytování biomedicínských informací ve Spojených státech i ve světě. Pokročilé biomedicínské informační služby NLM patří mezi nejnavštěvovanější webové stránky federální vlády.

NLM plní své poslání umožnit biomedicínský výzkum, podporovat zdravotní péči a veřejné zdraví a propagovat zdravé chování tím, že:

• Získává, organizuje, uchovává a poskytuje bezplatný online přístup k odborné biomedicínské literatuře z celého světa.
• Zajišťování přístupu k biomedicínským a zdravotnickým informacím v celé zemi ve spolupráci s více než 8 100 členy Národní sítě lékařských knihoven (NNLM).
• Slouží jako přední světový zdroj pro budování, kurátorství a poskytování sofistikovaného přístupu k molekulárně biologickým a genomickým datům, datům z klinických studií, datům o životním prostředí a dalším typům biomedicínských dat, včetně dat z vysoce významných iniciativ přesahujících rámec NIH.
• Provádění výzkumu a vývoje biomedicínských komunikačních systémů, metod, technologií a sítí a šíření a využívání informací mezi zdravotnickými pracovníky, pacienty a veřejností.
• Financování pokročilého výzkumu v oblasti biomedicínské informatiky a datové vědy a působení jako hlavní podporovatel před- a postdoktorského výzkumného vzdělávání v oblasti biomedicínské informatiky a datové vědy na 16 univerzitách.amerických univerzitách.

Důležité události v historii NLM

1836-Založena knihovna Úřadu generálního lékaře armády (dnešní Národní lékařská knihovna).

1865-John Shaw Billings, MD, jmenován vedoucím knihovny generálního lékaře, kterou rozvinul v národní zdroj biomedicínské literatury. Ve funkci ředitele působil do roku 1895.

1879-První svazek Index Medicus, prvního pokusu o identifikaci a kódování lékařské literatury, byl vydán.

1880-První svazek Index-Catalogue, vícedílné tištěné bibliografie, byl vydán.

1922-Knihovna Úřadu generálního chirurga (armáda) přejmenována na Armádní lékařskou knihovnu.

1952-Army Medical Library přejmenována na Armed Forces Medical Library.

1956-Akt Kongresu přesunul Armed Forces Medical Library pod U.S. Public Health Service (PHS) a přejmenoval ji na National Library of Medicine.

1961-Nová budova Národní lékařské knihovny č. 38 (8600 Rockville Pike, Bethesda, Maryland, v areálu NIH) byla slavnostně otevřena.

1964-Systém pro analýzu a vyhledávání lékařské literatury (MEDLARS), počítačový systém pro vyhledávání biomedicínských informací pro zdravotnické pracovníky, byl uveden do provozu v NLM.

1965-Zákon o pomoci lékařským knihovnám svěřil NLM odpovědnost za pomoc lékařským knihovnám v zemi prostřednictvím grantového programu a vytvořil síť regionálních lékařských knihoven (nyní Národní síť lékařských knihoven).

1968-NLM se stala součástí NIH. Lister Hill National Center for Biomedical Communications, výzkumná a vývojová složka NLM, vytvořená Kongresem.

1971-MEDLINE („MEDLARS Online“) zahájila činnost, aby poskytla online přístup k podmnožině referencí v databázi MEDLARS.

1972-TOXLINE, online bibliografická služba pokrývající farmakologii a toxikologii, zahájila činnost.

1980-NLM’s Lister Hill National Center for Biomedical Communications, building #38A, dedicated. V budově přiléhající ke knihovně jsou umístěny výzkumné a vývojové složky NLM.

1986 – zdravotnické komunitě byl představen uživatelsky přívětivý software pro přístup k MEDLARS.

1988 – Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) bylo v NLM založeno Kongresem jako národní zdroj informací z oblasti molekulární biologie.

1992 – NCBI převzalo odpovědnost za GenBank a účast USA v Mezinárodním konsorciu nukleotidových sekvencí.

1993-Národní informační centrum pro výzkum zdravotnických služeb a technologie zdravotní péče (National Information Center on Health Services Research and Health Care Technology) zřízené v NLM Kongresem jako národní zdroj informací o výzkumu zdravotnických služeb a pokynů pro praxi založenou na důkazech.

1993-objevily se webové stránky NLM (www.nlm.nih.gov).

1994-byl představen Visible Human Male, rozsáhlý počítačový soubor snímků založený na mrtvole. O rok později se objevila databáze Visible Human Female.

1997-Přístup do databáze MEDLINE/PubMed NLM se stal volným prostřednictvím celosvětové sítě.

1998-Vydání databáze MedlinePlus, která poskytovala přístup ke zdravotním informacím pro spotřebitele.

2000-ClinicalTrials.gov, online zdroj umožňující veřejnosti snadný přístup k informacím o výzkumných studiích.

2000-PubMed Central (PMC), bezplatný archiv literatury z biomedicínských a přírodovědných časopisů.

2002-NLM zahájila program putovních historických výstav vydáním knihy Frankenstein:

2003-NLM vydala standardní formát pro elektronickou archivaci a publikování článků v časopisech – JATS (Journal Article Tagging Suite), který se později stal národním standardem.

2004-ministr HHS jmenoval NLM koordinačním orgánem HHS pro standardy klinické terminologie.

2006-NIH vydává časopis MedlinePlus, který má Američanům poskytovat spolehlivé a aktuální informace o zdraví ve formátu vhodném pro spotřebitele. O dva roky později následovala španělsko-anglická verze Salud.

2006-dbGaP, databáze genomů a fenomů, byla spuštěna za účelem zpřístupnění celogenomových asociačních studií.

2006-DailyMed zpřístupnil veřejnosti a tvůrcům systémů elektronické strukturované etikety léčivých přípravků (příbalové letáky) schválené FDA.

2008-Politika veřejného přístupu NIH vyžadující ukládání recenzovaných článků, které jsou výsledkem výzkumu financovaného NIH, do PMC se stala povinnou, jak je uvedeno v zákoně o rozpočtových prostředcích na rok 2008.

2008-Ukládání souhrnných údajů o výsledcích v ClinicalTrials.gov se stalo povinným pro vybrané klinické studie léků a zařízení regulovaných FDA, jak je uvedeno v zákoně o změnách FDA z roku 2007.

2010-Vydána služba MedlinePlus Connect, která propojuje pacienty nebo poskytovatele v systémech elektronických zdravotních záznamů (EHR) se souvisejícími informacemi MedlinePlus o stavech nebo lécích.

2010-Standardy slovníku podporované nebo vyvinuté NLM (LOINC, RxNorm, SNOMED CT) zahrnuty do pravidla specifikujícího certifikační kritéria USA pro systémy elektronických zdravotních záznamů.

2015-AccessGUDID zpřístupnil veřejnosti informace o zdravotnických prostředcích předložené úřadu FDA.

2015-Ostatní agentury HHS a další federální ministerstva se rozhodly vyžadovat ukládání publikací vzniklých z jimi financovaného výzkumu do PMC.

2016-Patricia Flatley Brennan, RN, PhD, se stala první ženou a první zdravotní sestrou jmenovanou do čela knihovny.

2017-HHS vydalo konečné pravidlo pro registraci a vykazování souhrnných výsledků klinických hodnocení na webu ClinicalTrials.gov. NIH vydal zásady rozšiřující požadavky na všechna klinická hodnocení financovaná NIH.

2017-NLM zahájila svůj Strategický plán 2017-2027: Platforma pro biomedicínské objevy a zdraví podporované daty

2019-NIH časopis MedlinePlus začal být dostupný online v angličtině a španělštině.

2019-NLM veřejná data Archivu sekvenčních čtení (SRA) se přesunula do cloudu, čímž byla dokončena první fáze probíhajícího úsilí o lepší umístění těchto dat pro rozsáhlé výpočty.

2020-NLM spustila aktualizovanou verzi PubMedu, která poskytuje vylepšený design a technologie pro zlepšení uživatelského komfortu.

Legislativní chronologie NLM

3. srpna 1956 – novela hlavy III zákona o veřejné zdravotní službě, zákona o Národní lékařské knihovně, zařadila Lékařskou knihovnu ozbrojených sil pod PHS a přejmenovala ji na Národní lékařskou knihovnu (Public Law 84-941).

22. října 1965 – Zákon o pomoci lékařským knihovnám z roku 1965 (Public Law 89-291) schválil extramurální programy grantové pomoci NLM, které mají pomoci rozšířit a zlepšit národní lékařské knihovny a zdroje zdravotnické komunikace, technologie a odborný personál pro služby zdravotnické komunitě.

3. srpna 1968 – zákon č. 90-456 (Public Law 90-456) povolil zřízení Národního centra biomedicínských komunikací Lister Hill.

4. listopadu 1988 – zákon o rozšíření zdravotnických programů (Public Law 100-607) povolil zřízení Národního centra pro biotechnologické informace při NLM.

10. června 1993 – zákon o revitalizaci Národních ústavů zdraví (Public Law 103-43) povolil zřízení Národního informačního centra pro výzkum zdravotnických služeb a technologií zdravotní péče při NLM.

21. listopadu 1997 – zákon o modernizaci Úřadu pro potraviny a léčiva (Public Law 105-115) vyzval k vytvoření centralizovaného, pro spotřebitele přívětivého online seznamu klinických studií, kterým se stal ClinicalTrials.gov.

27. září 2007 – zákon o změnách v Úřadu pro potraviny a léčiva (Public Law 111-85) rozšířil rozsah klinických studií, které mají být registrovány na ClinicalTrials.gov, a rozšířil databázi o souhrnné výsledky dokončených klinických studií.

Životopisný portrét ředitelky NLM Patricie Flatley Brennanové, RN, PhD

Patricia Flatley Brennan, RN, PhD, je ředitelkou Národní lékařské knihovny, největší biomedicínské knihovny na světě.

Od svého nástupu do funkce ředitelky v srpnu 2016 Dr. Brennanová vytvořila z knihovny centrum biomedicínských dat v NIH a v celém biomedicínském výzkumu na celém světě. Stála v čele vývoje strategického plánu, který posiluje výzkum, vývoj, školení a informační systémy NLM.

Využitím datových a informačních zdrojů NLM, intramurálního výzkumu a extramurálních výzkumných a školicích programů Dr. Brennanová posiluje a rozvíjí datovou infrastrukturu NLM s cílem urychlit objevy a zdraví založené na datech, zapojit nové uživatele novými způsoby a rozvíjet pracovní sílu pro budoucnost založenou na datech.

Dr. Brennanová je průkopníkem ve vývoji inovativních informačních systémů a služeb. Její profesní úspěchy odrážejí její vzdělání, které spojuje inženýrství, informační technologie a klinickou péči s cílem zlepšit veřejné zdraví a zajistit co nejlepší zkušenosti s péčí o pacienty. Dr. Brennanová je jmenována přidruženou výzkumnou pracovnicí v oddělení intramurálního výzkumu Národního institutu pro ošetřovatelství, kde řídí laboratoř pokročilé vizualizace.

Dr. Brennanová přišla do NIH z University of Wisconsin-Madison, kde působila jako profesorka Lillian L. Moehlman Bascom na Fakultě ošetřovatelství a Vysoké škole inženýrské na University of Wisconsin-Madison. Vedla také laboratoř Living Environments Laboratory (nyní Virtual Environments Group) ve Wisconsin Institute for Discovery.

Magisterský titul v oboru ošetřovatelství získala na University of Pennsylvania a doktorát v oboru průmyslového inženýrství na University of Wisconsin-Madison. Po klinické praxi v oboru ošetřovatelství v intenzivní péči a psychiatrickém ošetřovatelství zastávala Dr. Brennanová akademické pozice na Marquette University v Milwaukee, Case Western Reserve University v Clevelandu a University of Wisconsin-Madison.

Jako bývalá prezidentka American Medical Informatics Association byla Dr. Brennanová v roce 2001 zvolena do National Academy of Medicine. Je členkou Americké akademie ošetřovatelství, Americké akademie lékařské informatiky a Newyorské lékařské akademie.

V roce 2020 byla Dr. Brennanová přijata do Amerického institutu lékařského a biologického inženýrství (AIMBE). Kolegium členů AIMBE patří k nejvyšším profesním oceněním udělovaným lékařským a biologickým inženýrům.

Vybraná bibliografie je k dispozici. Více informací o Dr. Brennanové se můžete dozvědět prostřednictvím jejího blogu Musings from the Mezzanine a jejího účtu na Twitteru: @NLMdirector.

NLM Directors

Name	In Office from	To
Leon Lloyd Gardner
Joseph Hamilton McNinch
Frank Bradway Rogers
Martin Marc Cummings
Donald A.B. Lindberg
Betsy L. Humphreys (Acting)
Patricia Flatley Brennan	2016	Present

Major Divisions

NLM’s Extramural Programs Division offers grant support for research projects and research training in biomedical informatics and data science. Výzkum v oblasti biomedicínské informatiky a datové vědy vyvíjí metody a přístupy ke zlepšení získávání, integrace, správy, analýzy, vizualizace, vyhledávání a využívání biomedicínských a behaviorálních informací a dat týkajících se lidského zdraví. Oddělení extramurálních programů poskytuje podporu základnímu i aplikovanému výzkumu v těchto a příbuzných oblastech.

S cílem rozšířit počet biomedicínských pracovníků v oblasti biomedicínské informatiky a datové vědy podporuje NLM vzdělávání v biomedicínské informatice na vzdělávacích institucích po celých USA. Tyto programy nabízejí předdoktorskou a postdoktorskou přípravu pro výzkumnou kariéru v oblasti zdravotnické informatiky, biomedicínské datové vědy, translační informatiky, informatiky klinického výzkumu, informatiky veřejného zdraví a příbuzných oblastí. Kromě toho jsou nabízena individuální předdoktorandská stipendia v biomedicínské informatice nebo datové vědě a také ocenění za kariérní přechod.

Granty jsou poskytovány také americkým malým podnikům, které se snaží provádět výzkum a vývoj v oblasti informatiky vedoucí ke komercializaci. Mezi kritické oblasti výzkumu patří pomoc spotřebitelům při vizualizaci zdravotních údajů, datová integrace rozsáhlých různorodých datových zdrojů, techniky umělé inteligence pro biomedicínské datové zdroje a vylepšování biomedicínských údajů, včetně osobních zdravotních údajů, aby byl umožněn přístup k údajům pro více uživatelů najednou. NLM se rovněž podílí na iniciativách NIH pro malé podniky, které se týkají přijetí standardu Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) pro výměnu elektronických zdravotnických informací, a hledání zdokonalených terapií a technik pro zlepšení měření a léčby bolesti v rámci podpory iniciativy NIH Helping to End Addiction Long-term (HEAL).

Oddělení extramurálních programů má dva jedinečné programy na podporu vývoje informačních zdrojů, které pomáhají snižovat rozdíly v oblasti zdraví, a na podporu vývoje zdrojů souvisejících s historií a filozofií medicíny a veřejného zdraví.

NLM je lídrem v oblasti výzkumného vzdělávání v biomedicínské informatice, výpočetní biologii a datové vědě. NLM podporuje 200 předdoktorandů a postdoktorandů ročně v oblasti biomedicínské informatiky a datové vědy v 16 univerzitních programech po celé zemi. Tyto programy podporují přihlášky osob tradičně nedostatečně zastoupených v biomedicínské informatice a výzkumu; jedenáct z těchto programů nabízí speciální krátkodobé letní školení s cílem posílit nábor. Ve finančním roce 2019 NLM spolupracovala s Národní vědeckou nadací na zapojení odborníků na výzkum datové vědy s biomedicínskými výzkumníky, kteří studují a vyvíjejí pokročilé analytické metody aplikované ve zdravotnictví.

Všechny aktivní grantové programy NLM, seznamy nedávných příjemců a kontaktní informace na pracovníky grantu jsou uvedeny na https://www.nlm.nih.gov/ep/.

Oddělení provozu knihovny (LO)

Oddělení provozu knihovny získává, organizuje, uchovává a zpřístupňuje sbírku NLM, která představuje intelektuální obsah a rozmanitost světové biomedicínské literatury, dat a dalších výzkumných objektů a informací. Tyto činnosti se řídí zásadami ochrany a uchovávání sbírky NLM, které v roce 2019 schválila správní rada NLM. LO také vytváří a šíří řízené slovníky včetně MeSH, UMLS a RxNorm a klasifikační schéma knihovny. LO je sídlem Národního informačního centra pro výzkum zdravotnických služeb a zdravotnických technologií, které poskytuje zdroje, jako je HSRProj, databáze výzkumných projektů v oblasti zdravotnických služeb.

LO vytváří autoritativní indexační a katalogizační záznamy a vytváří a distribuuje bibliografické, katalogizační a plnotextové databáze včetně MEDLINE prostřednictvím PubMed a DailyMed.

NLM využívá k oslovení veřejnosti více kanálů, včetně webových stránek určených pro spotřebitele, přímého kontaktu a komunitních sítí. Důvěryhodné a autoritativní zdravotní informace pro spotřebitele jsou k dispozici prostřednictvím MedlinePlus, MedlinePlus en español a MedlinePlus Connect, bezplatné služby, která propojuje pacientské portály a elektronické zdravotní záznamy se zdravotními informacemi pro spotřebitele.

NNLM je také domovem společného úložiště dat NIH Common Data Element Repository, které je součástí iniciativy NIH na podporu standardů zdravotních údajů v klinickém výzkumu a registrech pacientů. LO zajišťuje dodávání dokumentů, především prostřednictvím systému NLM DOCLINE, a zákaznický servis, který pomáhá lidem efektivně využívat sbírky a zdroje NLM.

Oddělení historie medicíny shromažďuje, uchovává, zpřístupňuje a interpretuje nejbohatší sbírku historických materiálů na světě, zahrnující období od 11. do 21. století, a to ve fyzické i digitální podobě, včetně programu historických výstav a blogu Circulating Now.

Úřad pro zapojení a vzdělávání (Office of Engagement and Training, OET), který je domovem Národní sítě lékařských knihoven (National Network of Libraries of Medicine, NNLM), zapojuje více než 8 100 akademických zdravotnických knihoven, nemocničních a veřejných knihoven a komunitních organizací po celých Spojených státech s cílem zlepšit přístup ke zdravotnickým informacím. Ve spolupráci s výzkumným programem NIH All of Us zapojuje NNLM komunity, které jsou nedostatečně zastoupeny v biomedicínském výzkumu, do poskytování informací o precizní medicíně. NNLM také zvyšuje kapacitu výzkumných knihoven a knihovníků v oblasti datové vědy pro správu a analýzu biomedicínských dat. OET koordinuje školení, zapojení a budování kapacit v oblasti nabídky NLM pro prioritní zúčastněné strany a veřejnost.

Intramurální výzkumný program

NLM provádí průkopnický výzkum s cílem rozšířit znalosti v oblasti biomedicínské informatiky, výpočetní biologie a datové vědy. Intramurální výzkumný program NLM sdružuje Národní centrum biomedicínských komunikací Lister Hill a pobočku Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI) pro výpočetní biologii.

Výzkumné portfolio NLM zahrnuje umělou inteligenci, výpočetní biologii, podporu klinického rozhodování a dohled nad veřejným zdravím. Výzkum NLM vytváří nové analytické přístupy a vizualizační nástroje, které pomáhají vědcům urychlit objevování na základě dat a převádět výsledky do klinických řešení. Tento výzkum přispívá k hlubšímu pochopení účinků léků, postupů a dalších faktorů, které ovlivňují lidské zdraví a prevenci a léčbu nemocí. NLM vytváří nástroje, které činí objevy a zdravotní údaje srozumitelnějšími pro pacienty, a pomáhá lidem přistupovat k vlastním zdravotním údajům, ukládat je, používat a rozumět jim.

NLM podporuje výzkum v oblasti zpracování lékařského jazyka, vysokorychlostního přístupu k biomedicínským informacím, analýzy a využívání vysoce kvalitních biomedicínských zobrazovacích dat a rozsáhlé analýzy klinických a administrativních dat s cílem předvídat výsledky léčby pacientů. Její práce potvrdila výsledky klinického výzkumu, pomohla lokalizovat a identifikovat viry, které představují hrozbu pro veřejné zdraví, a zdokonalila strojové učení a zpracování obrazu pro screening rakoviny děložního čípku a pomoc při včasné léčbě. Výzkum NLM v oblasti výpočetní biologie vytváří nové způsoby reprezentace a propojení genomických a biologických dat s biomedicínskou literaturou a prohlubuje porozumění evoluční genomice. NLM vytváří analytické softwarové nástroje pro získávání poznatků o genetických mutačních vzorcích a faktorech onemocnění, molekulárních vazbách a struktuře a funkci proteinů.

NLM také hostí postdoktorandy, kteří aplikují informatické vědy ve výzkumu, vzdělávání a klinické péči.

Národní centrum Lister Hill pro biomedicínskou komunikaci (LHNCBC)

Centrum Lister Hill pro biomedicínskou komunikaci bylo založeno v roce 1968 s cílem zlepšit komunikaci o zdravotnickém vzdělávání, výzkumu a praxi. Dnes se LHNCBC zaměřuje na zlepšování zdraví prostřednictvím metodologického pokroku v oblasti zdravotnických dat a informatiky. Činnost LHNCBC se soustřeďuje na klinická data a jejím cílem je vytvářet interoperabilní data, škálovatelné metody a převádět výzkumné objevy do praxe.

Kromě přispívání do programu intramurálního výzkumu NLM pracovníci LHNCBC převádějí poznatky z výzkumu do produktů a služeb nabízených veřejnosti (např, Open-i®, vyhledávač biomedicínských obrázků s otevřeným přístupem) a výzkumné komunitě (např. softwarový balík NLM Scrubber pro odstraňování identifikace klinických textů) nebo pro použití v provozu NLM (např. nástroj Medical Text Indexer, který vytváří doporučení pro indexaci citací MEDLINE). LHNCBC má dlouhou tradici v používání technik umělé inteligence na klinické snímky pro diagnostické nebo prognostické účely. Příklady zahrnují identifikaci parazitů malárie v krevních nátěrech, klasifikaci rentgenových snímků hrudníku na tuberkulózu a detekci a stanovení stadia rakoviny děložního čípku z fotografií děložního hrdla a histologických snímků. Pracovníci LHNCBC rovněž vedou vývoj, zdokonalování a přijímání klinických slovníků (např. SNOMED CT, LOINC a RxNorm) a standardů informačních modelů se zaměřením na standard HL7 FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) pro výměnu klinických informací.

Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)

Kongres založil Národní centrum pro biotechnologické informace v roce 1988 jako divizi NLM a jako národní zdroj informací z oblasti molekulární biologie. Od té doby je NCBI předním zdrojem veřejných biomedicínských databází, softwarových nástrojů pro analýzu molekulárních a genomických dat a výzkumu v oblasti výpočetní biologie

NCBI vytváří a spravuje více než 40 databází pro lékařské a vědecké komunity i širokou veřejnost; patří mezi ně literární, molekulární a genomické databáze. Základní literární databází NCBI je PubMed, která poskytuje abstrakty a citace milionů článků z tisíců biomedicínských časopisů. Záznamy v databázi PubMed obsahují odkazy na plné texty článků (pokud jsou k dispozici) z elektronického archivu PubMed Central (PMC) NCBI a z webových stránek časopisů, jakož i odkazy na související informace z jiných stránek NCBI, například z genomických a molekulárních databází.

Mezi základní genomické a genetické zdroje NCBI patří GenBank, anotovaná sbírka všech veřejně dostupných sekvencí DNA; RefSeq, kurátorská sbírka sekvencí DNA, RNA a proteinů; Sequence Read Archive (SRA), kde jsou uložena data z vysoce výkonného sekvenování; dbSNP, databáze krátkých genetických variací (oblastí genomu, u kterých bylo zjištěno, že se mezi lidmi liší); dbGaP, databáze, která propojuje údaje o genotypech a fenotypech z celogenomových asociačních studií (GWAS) a dalších studií; ClinVar, sbírka hlášených vztahů mezi genetickými variacemi a pozorovaným zdravotním stavem; registr genetického testování, databáze genetických testů; a zdroj Pathogen Detection, který integruje údaje o sekvencích bakteriálních patogenů získaných z potravin, životního prostředí a lidských pacientů s cílem usnadnit aktivní dohled nad patogeny a nemocemi z potravin v reálném čase. NCBI rovněž vytváří ClinicalTrials.gov, databázi soukromě i veřejně financovaných klinických studií prováděných po celém světě. Další databáze zahrnují informace o chemických strukturách a jejich biologických aktivitách, sekvencích proteinů, struktuře proteinů, chromozomálních aberacích u rakoviny, genech a genové expresi, taxonomii a další.

Office of Computer and Communications Systems (OCCS)

Office of Computer and Communications Systems poskytuje služby informačních technologií a technické poradenství na podporu výzkumných a řídicích programů nabízených prostřednictvím NLM. OCCS spravuje a provozuje páteřní síť NLM, připojení k internetu a sítím Internet2, interní počítačové sítě v rámci NLM, zařízení datového centra NLM na místě i mimo něj, platformy pro podnikové výpočty a úložiště, platformy pro výpočty koncových uživatelů a technologie pro mobilní uživatele a vzdálený přístup.

OCCS vyvíjí a provozuje IT služby a softwarové aplikace, které podporují poslání knihovny. OCCS vyvíjí aplikace pro interní i veřejné použití – se specifickými znalostmi v oblasti vývoje softwarových aplikací, které používají standardizovanou lékařskou terminologii.

OCCS poskytuje zákaznickou podporu, školení a dokumentaci pro uživatele počítačů a sítí. Kromě toho OCCS vyvíjí standardy a pokyny pro správu a používání informačních technologií v NLM v souladu s osvědčenými postupy v oboru a příslušnými mandáty federální vlády. OCCS poskytuje dohled nad všemi programy zabezpečení informací v NLM a zajišťuje, aby informační systémy NLM splňovaly federální standardy zabezpečení informací.

Jako hlavní informační úředník NLM schvaluje ředitel OCCS akvizice související s informačními technologiemi, dohlíží na proces řízení investic NLM do informačních technologií a zajišťuje, aby NLM dodržovala příslušné federální zákony, směrnice a standardy.