Usługi Obszaru Metropolitalnego Tokyo-Yokohama
Edo posiadało rozbudowany, choć niewystarczający, system akweduktów. Trzy główne doprowadzały wodę z wyżyn położonych na zachód od miasta. Wiele domów i skupisk domów miało studnie, które mogły okazać się słonawe, szczególnie na nizinach. (Niektóre dzielnice na wschód od Sumidy leżały poniżej poziomu morza. Osiadanie, wynikające z czerpania wody podziemnej, sprawiało, że zapadały się jeszcze niżej). Dlatego dostarczanie słodkiej wody było dobrze prosperującym biznesem.
Większość wody dla miasta pochodzi obecnie z rzek Tama i, w coraz większym stopniu, Tone. Tokio chciałoby pójść jeszcze dalej, doprowadzając wodę, która obecnie wpływa do Morza Japońskiego, przez góry tunelem do Tone. Nie może tego zrobić samodzielnie, a w prefekturze wiejskiej, której to głównie dotyczy, panuje sprzeciw. Jokohama i Kawasaki czerpią wodę z rzeki Sagami, która wznosi się u podnóża góry Fuji i wpada do oceanu w niewielkiej odległości na południowy zachód od Jokohamy.
W Edo nie istniała kanalizacja. Powszechnym sposobem usuwania odpadów był wózek kanalizacyjny, czasami nazywany „wiadrem miodu”. Rynek sprzedawcy, na którym wozak płacił za ścieki, stopniowo stawał się rynkiem kupującego, w miarę jak miasto się rozrastało, a pola, na które jeździły wozy, oddalały się. W latach po I wojnie światowej, Shinjuku było znane jako „odbyt Tokio”. Przebiegała przez nie główna trasa na pola, a każdego popołudnia i wieczoru wozy zapychały się wzdłuż głównej ulicy. Nawet w latach po II Wojnie Światowej Tokio było miastem o bardzo nieprzyjemnym zapachu. Cel, jakim jest objęcie kanalizacją wszystkich obszarów zabudowanych, jest w zasięgu ręki. Prawdopodobnie nigdy nie dotrą one do odległych gór i wysp.
Dziesiątki tysięcy ton śmieci muszą być usuwane każdego dnia. Masa rośnie szybciej niż populacja, ponieważ dostatek przynosi mniej ostrożne i wydajne nawyki konsumpcyjne niż w przeszłości. W latach po Igrzyskach Olimpijskich w 1964 roku miasto było na skraju wojny domowej o to, co zrobić z ogromnym nagromadzeniem śmieci. Biedniejsze wschodnie okręgi zostały wezwane do pozbycia się go, a zamożne zachodnie okręgi wyprodukowały większość z niego. Rząd prefekturalny zgodził się, że ustalenia dotyczące usuwania śmieci były niesprawiedliwe. Dziś w całym mieście znajdują się zakłady utylizacji śmieci, które spalają to, co mogą. Reszta trafia na wysypiska w zatoce, które są sercem najbardziej okazałych planów rozwoju miasta. Choć znajdują się na nich ładne parki, w większości przypadków pozostają one oczami wyobraźni. Z jednego z takich wysypisk, nazwanego z wielką, choć prawdopodobnie niezamierzoną ironią „Wyspą Marzeń” (Yume no shima), pochodziła w 1965 roku ogromna plaga much, która ogarnęła wschodnią część miasta. Od tego czasu teren jest pod lepszą kontrolą, ale nadal pozostaje niezbyt wymarzonym miejscem.
Elektryczność i gaz są dostarczane przez prywatne firmy. Firma elektryczna ma zakłady, w tym jądrowe, tak daleko jak wybrzeże Morza Japońskiego. Większość gazu jest produkowana w zakładzie wzdłuż zatoki w Jokohamie, który jest powszechnie uznawany za cud zaawansowanej technologii.