Napoleon a reușit să se împace cu Biserica Catolică. Franța era divizată din 1789, când Adunarea Națională a pus biserica sub controlul statului. Papa își pierduse dreptul de a numi preoți și episcopi în Franța. Terenurile bisericii fuseseră confiscate. Cine era acum proprietarul de drept? Biserica de la Roma pretindea că este. Acest lucru a provocat o mare instabilitate, iar Napoleon era hotărât să pună capăt discordiei.

În 1801 a semnat un acord cu Papa Pius al VII-lea prin care restabilea Biserica din Franța… A fost Concordatul din 1801. Dar a fost în condițiile lui Napoleon. Biserica a fost de acord să renunțe la pretențiile lor asupra pământurilor pierdute. Principiul libertății religioase pe care revoluția îl garantase a rămas în vigoare. Guvernul va continua să selecteze episcopii, dar îi va supune aprobării Papei. Episcopii urmau să numească numai preoți acceptați de guvern. In return Napoleon graciously recognized the Catholic Church as the religion of the great majority of Frenchmen. The Church had lost much, but the dispute was over.