Beküldési útmutató

Génnómenklatúra

A génszimbólumok esetében a jóváhagyott nómenklatúrát kell használni, és a dőlt betűs teljes nevek helyett szimbólumokat kell használni (például Ttn, nem titin). A helyes génneveket és szimbólumokat a megfelelő nómenklatúra-adatbázisokban találja meg. Hasznos forrás az Entrez Gene.

A jóváhagyott emberi génszimbólumokat a HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC), e-mail: [email protected]; lásd még: www.genenames.org.

A javasolt, még nem jóváhagyott génnevek esetében kérjük, hogy a génszimbólumokat a lehető leghamarabb nyújtsa be a megfelelő nómenklatúra-bizottságoknak, mivel azokat a cikk közzététele előtt kell letétbe helyezni és jóváhagyni.

Kerüljük a gének (vagy fehérjék) többszörös nevének felsorolását kötőjellel elválasztva, mint például az “Oct4/Pou5f1”-ben, mivel ez nem egyértelmű (jelenthet arányt, komplexet, alternatív neveket vagy különböző alegységeket). Használja végig az egyik nevet, a másikat pedig az első említéskor tüntesse fel: “Oct4 (más néven Pou5f1)”.

Kémiai és biomolekuláris anyagok jellemzése

A Scientific Reports elkötelezett a technikailag megalapozott kutatások publikálása mellett. A folyóirathoz benyújtott kéziratokat szigorú előírásoknak vetjük alá a kísérleti módszerek és az új vegyületek jellemzése tekintetében.

A kéziratban leírt minden egyes új vegyület azonosságának és tisztaságának megállapítását megfelelő adatokkal kell alátámasztania. A tudományos vizsgálat szempontjából központi szerepet játszó ismert vegyületek forrását, azonosságát és tisztaságát megerősítő nyilatkozatot kell mellékelnie, még akkor is, ha azokat vásárolta vagy publikált módszerekkel újraszintetizálta.

Kémiai azonosság

A szerves és fémorganikus vegyületek kémiai azonosságát spektroszkópiai elemzéssel kell megállapítani. Minden új vegyület esetében meg kell adni az 1H NMR és a proton-dekapcsolt 13C NMR szabványos csúcslistáját (lásd az alábbi formázási irányelveket). Adott esetben más NMR-adatokat is be kell jelenteni (31P NMR, 19F NMR stb.). Új anyagok esetében a molekulatömeg-azonosságot alátámasztó tömegspektrális adatokat is meg kell adni. A nagy felbontású tömegspektrum (HRMS) adatok előnyben részesülnek. Adott esetben UV- vagy IR-spektrumadatokat is közölhet a jellemző funkciós csoportok azonosításához. A kristályos anyagok esetében meg kell adnia az olvadáspont-tartományokat. A királis vegyületek esetében megadhatja a specifikus forgásokat. Az ismert vegyületek esetében a részletes eljárások helyett inkább hivatkozásokat kell megadni, kivéve, ha a protokollok eltérnek a közzétett módszerektől vagy javítják azokat.

Kombinatorikus vegyületkönyvtárak

A kombinatorikus könyvtárak előállításának leírásakor a könyvtárkomponensek változatos csoportjára vonatkozó szabványos jellemzési adatokat kell megadni.

Biomolekuláris azonosság

Új biopolimer anyagok (oligoszacharidok, peptidek, nukleinsavak stb.) esetében a közvetlen szerkezeti elemzés NMR spektroszkópiai módszerekkel nem feltétlenül lehetséges. Ezekben az esetekben az azonosságot szekvencia (adott esetben) és tömegspektrális jellemzés alapján kell igazolnia.

Biológiai konstrukciók

A biológiai konstrukciók (plazmidok, fúziós fehérjék, helyirányított mutánsok stb.) azonosságát igazoló szekvenálási vagy funkcionális adatokat a kézirat szövegében vagy adott esetben a Módszerek részben kell megadnia.

Minta tisztaság

A minta tisztaságának igazolását kérjük minden új vegyület esetében. A tisztaságvizsgálat módszerei a vegyület osztályától függnek. A legtöbb szerves és fémorganikus vegyület esetében a tisztaságot nagymezős 1H NMR vagy 13C NMR adatokkal lehet bizonyítani, bár kis molekulák esetében ajánlott az elemanalízis (±0,4%). A kis molekulák és polimer anyagok tisztaságának bizonyítására kvantitatív analitikai módszereket, többek között kromatográfiás (GC, HPLC stb.) vagy elektroforetikus elemzéseket is használhat.

Spektrális adatok

A módszerek részben kérjük, hogy az új vegyületek részletes spektrális adatait listás formában (lásd alább) adja meg. A spektrumokat tartalmazó ábrákat általában nem közöljük a kézirat ábrájaként, kivéve, ha az adatok közvetlenül kapcsolódnak a dolgozat központi következtetéseihez. Javasoljuk, hogy a kulcsfontosságú vegyületek spektrális adatainak jó minőségű képeit csatolja a Kiegészítő információkhoz. Az integrációs értékek után csak akkor tüntesse fel a konkrét NMR hozzárendeléseket, ha azokat egyértelműen többdimenziós NMR- vagy szétkapcsolási kísérletekkel határozták meg. A hozzárendelések módjáról egy általános Módszerek részben kell tájékoztatást adnia.

Kismolekulák kristályográfiai adatai

Ha kézirata kis molekulák kristályográfiai elemzésből származó új háromdimenziós szerkezetéről számol be, akkor kiegészítő információként csatoljon egy .cif fájlt és egy szerkezeti ábrát valószínűségi ellipszoidokkal a publikáláshoz. Ezeket az IUCR CheckCIF rutinjával ellenőrizni kell, és a beadványhoz csatolni kell a kimenet PDF-másolatát, valamint a jelentett riasztások indoklását. A kis molekulákra vonatkozó kristályográfiai adatokat a Cambridge Structural Database-hez kell benyújtani, és a kéziratban megfelelően hivatkozni kell a lerakási számra. A publikáláskor teljes hozzáférést kell biztosítani.

Makromolekuláris szerkezeti adatok

Ha a kézirat új szerkezetekről számol be, tartalmaznia kell egy táblázatot, amely összefoglalja a szerkezeti és finomítási statisztikákat. Az NMR- és röntgenkrisztallográfiás adatokat leíró ilyen táblázatokhoz sablonok állnak rendelkezésre. A szerkezeti adatok minőségének értékelését megkönnyítendő, a kézirathoz csatolni kell az elektronsűrűség-térkép egy részének sztereó képét (kristályográfiai dolgozatok esetében) vagy a legalacsonyabb energiájú struktúrák (≳10; NMR dolgozatok esetében) szuperponált képét. Ha a közölt szerkezet egy újszerű átfogó hajtást képvisel, akkor a teljes szerkezet sztereoképét is be kell nyújtania (gerincnyomként).

Regisztrált jelentések

A regisztrált jelentések olyan eredeti kutatási cikkek, amelyek az adatgyűjtés és elemzés előtt szakértői értékelésen esnek át. Ezt a formátumot úgy tervezték, hogy minimalizálja a publikációs torzítást és a kutatási torzítást a hipotézisvezérelt kutatásokban, ugyanakkor rugalmasságot biztosít a feltáró (nem regisztrált) elemzések elvégzéséhez és a véletlenszerű eredmények közléséhez. Ha regisztrált jelentést kíván benyújtani a Scientific Reports-hoz, kérjük, olvassa el a részletes irányelveket itt.